1. Czy podane primery są prawidłowo zaprojektowane. Wyjaśnij dlaczego:
F: 5’CGTAAGTCCACTGATGATCC 3’
R: 5’GGATCATCAGTGGACTTACG 3’
Nie, ponieważ nie są komplementarne
2. W skład DNA wchodzą: abcd
a) puryny A i G
b) pirymidyny T i C
c) cukier deoksyryboza
d) reszta kwasu fosforanowego
3. Zgodnie z zasadą komplementarności: d A łączy się z T 2 mostkami wodorowymi
4. Białka SSB (single-strand DNA Binding Proteins): a wiążą się z pojedenczymi nićmi DNA
5. DNA można wizolować z:
6. Najlepszym i najcześciej stosowanym antykoagulantem do zabezpieczenia krwi w celu późniejszej izolacji DNA jest: abcd EDTA, wersenian sodowy, cytrynian sodowy, heparyna
7. Precypitację DNA (wytrącanie klucza DNA) z roztworu przeprowadzamy używając: a 96% etanolu
8. Po ilu cyklach PCR uzyskamy 8 kopii DNA: po 3
9. Podczas rozpipetowywania samego miksu do reakcji PCR: b musimy za każdym razem zmieniać tips na pipecie
10. Prawdą jest że: ad do wizualizacji DNA w świetle UV wykorzystywany jest bromek etydyny, bufor obciążający migruje w tym smym kierunku, co fragmenty DNA
11. Podkreślone sekwencje to miejsca, w których zaplanowano zaprojektowanie primerów służacych do aplifikacji wytłuszczonego fragmentu DNA podaj sekwencję obydwu primerów:
F5’-CAGCTCGTATATGTAGTAGC 3‘ Tm= 2*11 +4*9= 58oC
R5’-TTAGATGCGCAGATGACGAT 3’ Tm= 2*11+ 4*9 =58oC
12. Wymień co najmniej cztery składniki mieszaniny reakcyjnej PCR: Matryca DNA, bufor, H2O, dNTP
13. Prawidlowa kolejność etapów pojedyniczego cyklu PCR to: d
Denaturacja, przyłączanie starterów, elongacja
14. Zgodnie z zasadami układania primerów: bcd
Przy obliczaniu temp przyłączania promerów zaleca się używania pustej reguły „2+4” wyrażonej wzorem na topnienie, ilość AT powinna być zbliżona do ilości GC, długość primerów powinna mieć około 20bp.
15. Zaznacz bieguny elektroforetyczne: u góry + n dole -
16. Dopisz sekwencję mRNA, który powstanie na poniższym fragmencie DNA:
5’-CTTGCATGT-3‘ DNA (nić kodująca)
5’-CUUGCAUGU-3’ (mRNA)
17. Cechy RNA to: c zamiast tyminy występuje w DNA, W RNA znajduje się uracyl
18. tRNA: ab posiada kształt listka koniczyny, spełnia rolę transportera doprowadzającego aminokwasy do rybosomów
. Do izolacji RNA używamy:
19. Dojrzewanie mRNA, polega na: Ac
Wycinaniu intronów i składaniu egzonów (splicing), powstawaniu na końcu 3’ potranskrypcyjnego RNA sekwencji Poli… na 5’ końcu struktury CAP
20. ESE (exonic splicing enhancers) to: b miejsce w intronach, gdzie rozpoczyna się proces splicingu
21. Proces odwrotnej transkrypcji przeprowadzamy: a używając promera poliT
22. Kiedy przeprowadzamy test RNA: ac
W przypadku, gdy amplifikowany fragment DNA jest zbyt długi, podczas procedury wykrywania zrearanżowanych form genu BCR-ABL
23. RNA-zin:
24. Technika multiplex-PCR może być zastosowany do: abc wykrywania reranżacji b2a2, b3a2 genu fuzyjnego BCR-ABL, wykrycia kilku różnych mutacji danego genu, wykrycia re aranżacji ela2 genu BCR-ABL
malwusik1990