1. Euchromatyna, heterochromatyna – różnice
Euchromatyna – to kompleks DNA i białek w jądrach interfazowych, tworzy długie, rozproszone, luźno upakowane włókna, podlega transkrypcji. Ma też regiony nieaktywne.
Heterochromatyna – to kompleks DNA i białek w jądrach interfazowych, tworzy gęsto upakowane, powtarzające się sekwencje DNA, nie ulega transkrypcji, ale ma wpływ na jej prawidłowość. Występuje podczas mitozy.
2. Crossing over – to wymiana fragmentów DNA między chromosomami homologicznymi, jest to tzw. rekombinacja genetyczna.
3 cechy splajsingu
- przecięcie 5’ końca intronu
- przecięcie 3’ końca intronu
- ligacja egzonów
4. Struktura lassa – zostaje utworzona w czasie splicingu (wycinanie intronów) w wyniku reakcji transestryfikacji: przecięcie 5’ końca intronu tworzy strukturę lassa i łączy się z resztą 2-adenozyny w tzw. punkcie rozgałęzienia
5. Powstanie chromosomu Philadelphia – w wyniku translokacji wzajemnej między 9 i 22 chromosomem, translokacja powoduje powstanie genu fuzyjnego bcr-abl
6. Dogmat biologii molekularnej
Obejmuje:
Replikacja – powielenie DNA i uzyskanie tego samego, co pierwotny
Transkrypcja – nie jest wymagana replikacja by do niej doszło, musi natomiast rozpleść się DNA by można było dojść do danego odcinka potrzebnego do przeniesienia z niego informacje na mRNA. Translacja – synteza białek w cytoplazmie.
7. Kto i kiedy odkrył kwas nukleinowy?
1928r. doświadczenie Griffita z myszami polegało ono na podaniu myszy Streptococcus pneumoniae w formie gładkiej (zjadliwej) i szorstkiej (niezjadliwej). Gładka powodowała śmierć myszy a szorstka nie powodowała zmian. Po podaniu martwych odmian gładkich z dodatkiem odmian szorstkich żywych i tak powodowało to śmierć myszy, co wskazuje na to, że bakterie niezjadliwe uległy transformacji pobierając DNA odmiany gładkiej – zjadliwej. W 1944 - McLeod i McCart poznają chemiczny czynnik transformującego DNA. W 1953 – Chase i Hershey stosują „piętnowanie azotem” i odkrywają, że DNA jest nośnikiem informacji genetycznej a nie białko. Wilkins i Franklin poznają budowę helikalną DNA.
8. Produkty transkrypcji, translacji
Transkrypcja: pre – RNA,
Translacja: białka (polipeptydy)
9. Co to Shine-Dalgarno, do czego jest komplementarna – sekwencja mRNA u Prokariota, AGGAGGG, jest ona komplementarna do konserwatywnej sekwencji na 3’ końcu mniejszej podjednostki rybosomów
10. splicing – to modyfikacja mRNA po transkrypcji, proces zachodzi w jądrze komórkowym, polega na wycięciu intronów (niekodujących sekwencji nukleotydów) z pre-mRNA w wyniku tego otrzymujemy nieprzerwalny ciąg egzonów (kodujące sekwencje nukleotydów).
11. Wiązania chemiczne między 2 niciami DNA
Wiązania wodorowe, pomiędzy A-T podwójne, a G-C potrójne
12. Co syntetyzuje rybosom?
Polipeptydy – białka
13. z czego składa się miejsce oriC u Prokariota
-sekwencje bogate TA
-DnaA boxy
-GATC miejsca metyzacji
14. Antykodon tRNA – to trójka nukleotydów znajdujących się w pozycji cząst. tRNA mogąca tworzyć wiązania wodorowe z kodonem w mRNA
15. Przydziel nici do procesu, określ kierunek
Replikacja: nić wiodąca 5’---3’, nic opóźniona 3’---5’
Transkrypcja: nić matrycowa 3’---5’, nić kodująca 5’---3’
16. Enzymy w replikacji
Polimeraza DNA, prymasa DNA, ligaza DNA, helikaza, topoizomeraza
17.Modyfikacja pre-mRNA przed splicingiem
Modyfikacja mRNA wymaga fosforowanej formy CTD. CTD koordynuje przyłączenie czapeczki guanylowej do 5’ końca, poliadenylację do 3’ końca i wiązanie czynników wycinających introny.
18. hnRNA – to pre-mRNA – jest to bezpośredni produkt transkrypcji, zawierający egzony i introny.
19. Budowa genu eukariotycznego
5’ region regulatorowy – promotor – egzony, introny – miejsce poliadenylacji 3’
20. Czy końce DNA/RNA są takie same?
Nie, jeden koniec łańcucha ma węgiel 5’ a drugi koniec łańcucha węgiel 3’. Na jednym z końców znajduję się grupa tri fosforanowa połączona z atomem węgla 5’, a na drugim grupa hydroksylowa połączona z atomem węgla 3’.
21. Główny cel PCR – namnażanie obcego DNA w probówce
22. Fragmenty Okazaki – proces, gdzie, co łączy, jaki enzym syntetyzuje
Replikacja, powstają na nici opóżnionej, łączone są przez ligazę, syntetyzuje je polimeraza DNA na końcu 3’
23. tRNA f Met, tRNA m Met – funkcje
tRNA f Met – sygnał startowy AUG
tRNA m Met – wydłuża łańcuch polipeptydowy
24. Sekwencja Kozak – proces, gdzie
Występująca w mRNA u eukariontów. U eukariontów taka sekwencja mRNA jest rozpoznawana przez rybosom, jako miejsce, od którego mRNA jest przepisywany na kolejność aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym w procesie translacji.
25. splicesomy – składają się z małego jąderka RNA i około 70 białek, niezbędne do splicingu.
26. Ekspresja genu - demetylacja CpG
27. Replikacja - w jakim kierunku biegnie synteza obu nici i dlaczego
W kierunku 5’->3’ ponieważ polimeraza DNA syntezuje w takim kierunku tylko i wyłącznie.
28. Sekwencja TATA
29. Czynnik rho
30. Nukleoid, nukleonom, nukleotyd
Nukleoid to chromosom prokariotyczny w postaci dwuniciowej, koliście zamkniętej nici DNA. Posiada domeny, które przytwierdzają się do błony komórkowej tworząc nukleoid. Struktura ta jest utrzymywana dzięki białkom wiążącym tj: HU, H-NS (białka histonopodobne), polimerazy, represory.
Nukleosom – to 2 pętle owinięte na oktamerze histonowym zbudowanym z 8 histonów: H2A x2, H2B x2, H3 x2, H4 x4 (rdzeń nukleosomu), dodatkowo H1 stabilizuje tą strukturę tworząc chromotosom. Histony rdzeniowe silnie wiążą się z DNA, (bo mają ładunek dodatni).
Nukleotyd – tworzy nukleozyd (cukier połączony kowalencyjnie z rybozą bądź deoksyrybozą w miejscu 1’ lub 2’) oraz grupy fosforanowe, które łączą cukry wiązaniem fosfodiestrowym między 5’ jednego cukru a 3’ drugiego.
31. Czy RNA może być czynnikiem genetycznym, jeśli tak podaj przykład?
32. Gdzie znajduje się informacja o 1 białku, a gdzie o całości białek?
Petroc